Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms