Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms