Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.9 ms