Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms