Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms