Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms