Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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