Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms