Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms