Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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