Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms