Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MICAQ29983 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms