Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms