Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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