Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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