Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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