Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CARTPTQ16568 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms