Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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