Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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