Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms