Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EEA1Q15075 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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