Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms