Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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