Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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