Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms