Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAPSNQ13702 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms