Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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