Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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