Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms