Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGB3BPQ13352 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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