Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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