Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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NFX1Q12986 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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NFX1Q12986 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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NFX1Q12986 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms