Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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LMAN2Q12907 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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