Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TWF1Q12792 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TWF1Q12792 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TWF1Q12792 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TWF1Q12792 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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