Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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