Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAMSAP2Q08AD1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP2Q08AD1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms