Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC1Q08554 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms