Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AP000873.4-201ENST00000528133 905 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms