Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms