Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms