Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms