Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms