Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms