Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms