Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms