Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms