Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms