Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IQGAP1P46940 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms