Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms