Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms